Skip to Main Content

Projekty badawcze w sieci VIA CARPATIA

Szczegóły projektu badawczego

Numer umowy
HOR.hn.802.12.2018
Wykonawcy badań
RC/ WYDZIAŁ CHEMICZNY/ Rektor PRz
Tytuł
Selekcja genomowa pszenicy ozimej - 2018
Streszczenie
Proponowane badania mają na celu poszerzenie wiedzy na temat uwarunkowań genetycznych i epigenetycznych oraz mechanizmów kształtujących zmiany w wysokości plonowania skrobi. Plon jest niezwykle złożoną cechą, a hipoteza badawcza zakłada, że część tej zmienności jest kształtowana przez zmiany epigenetyczne. Realizacja przewidzianych badań pozwoli na określenie udziału i roli tych zmian w kształtowaniu plonu. Celem badań są 1) oznaczenia zmienności genetycznej w grupie 200 genotypów pszenicy zwyczajnej scharakteryzowanych pod względem plonu, 2) konwersja wybranych markerów metGBS lub DArTseq i 3) ocena zmienności fenotypowej w doświadczeniu porównawczym w wybranych lokalizacjach. Analiza asocjacyjna danych powinna zaowocować opracowaniem markerów o istotnych efektach związanych z wysokością plonu.
Program
dotacja na pokrycie kosztów badań podstawowych na rzecz postępu biologicznego w produkcji roślinnej w 2018 r.
Rezultat badań
Wdrożenie metody met-GBS - modyfikacja DNA (utrwalenie zmian metylacyjnych) i przygotowanie zmultipleksowanej biblioteki dostosowanej do sekwenatora MiSeq (12 próbek x 2 powtórzenia) - analiza wydajności, pokrycia i powtarzalności wyników Oznaczenia GBS do mapowania asocjacyjnego - przygotowanie 3 bibliotek łącznie dla około 200 genotypów pszenicy zwyczajnej i sekwencjonowanie NGS - analiza danych i ekstrakcja markerów SNP - analiza asocjacji i wybór markerów do selekcji genomowej Ocena fenotypowa 200 rodów pszenicy zwyczajnej (zestaw do mapowania asocjacyjnego) w doświadczeniu 5-stacyjnym
Możliwość zastosowania rezultatów
Wyniki stanowią podstawę do opracowania modelu selekcji genomowej pszenicy zwyczajnej w oparciu o dedykowany dla pszenicy system markerów GBS.
Uczelnia
Politechnika Rzeszowska

Informacje o projekcie

Wersja: 0.1b Właścicielem i administratorem danych zawartych w bazie danych są uczelnie: Politechnika Rzeszowska, Politechnika Lubelska oraz Politechnika Białostocka. Zaprojektowanie witryny: mgr inż. Paweł Kuraś
Built with using Oracle APEX